الصفحة الرئيسية
عن المركز
كلمة مدير المركز
رقم قرار وتاريخ إنشاء المركز
رؤيتنا ورسالتنا
أهدافنا
إنجازاتنا
الهيكل الإداري
إدارة المركز
المجلس التنفيذي
اللجنة الإدارية
اللجنة الاستشارية العلمية
لجنة الدراسات العليا
اللجنة الأخلاقية للبحوث
لجنة برنامج طالب النخبة
الوحدات الإدارية
وحدة السكرتارية
وحدة شؤون الموظفين
وحدة الطلبات والمشتريات
وحدة تقنية المعلومات
وحدة المالية
وحدة العلاقات العامة والتسويق
وحدة المواصلات والمراسلات
الباحثون
الأعضاء
الباحثون الرئيسيون
طاقم الباحثين
برنامج العلماء الأعلى مرجعية واقتباساً
فنيو المعامل
البرامج البحثية
عن البرامج البحثية
البرنامج البحثي في جينوم أمراض السرطان
البرنامج البحثي للفحص الجينومي
البرنامج البحثي لجينوم الأمراض العصبية
البرنامج البحثي في الحينوم الدوائي
البرنامج البحثي لحينوم الخلايا الجذعية
البرنامج البحثي في البنوك الحيوية
البرنامج البحثي في الجينوم الجنيني والوظيفي
الوحدات الخدماتية البحثية
عن الوحدات الخدماتية البحثية
وحدة البنك الحيوي
وحدة الصورة الحيوية
وحدة المعلومات الحيوية
وحدة التقنية الطبية الحيوية
وحدة التشخيص للجينوم الطبي
وحدة الصبغيات الوراثية
الوحدة الوراثية الجزيئية
وحدة التدقيق الخلوي
وحدة الاستشارات الوراثية
وحدة التسلسل الجيني المتطور
وحدة الهستوياثولوجي
وحدة المصفوفات المجهرية للحامض النووي(الأفي متركس)
وحدة المصفوفات المجهرية للحامض النووي (الأجيلنت)
وحدة جينوم الصيدلة واكتشاف العقاقير
وحدة التشخيص الجيني للأجنة
وحدة البروتيوميات و الايضات
وحدة التنميط الجيني
وحدة التشوهات الجنينية والسمية
وحدة زراعة الأنسجة
التعليم وبرنامج التوعية
عن التعليم وبرنامج التوعية
برنامج الدكتوراة
عن البرنامج
طلاب الدكتوراة
برنامج الماجستير
عن البرنامج
طلاب الماجستير
برنامج التدريب
عن البرنامج
البرنامج التدريبي المتخصص في علم دراسة الخلايا
برنـامج التـوعية الشامل
الجهات المتعاونة
عن الجهات المتعاونة
الجهات المتعاونة المحلية
الجهات المتعاونة الدولية
برنامج إدارة الجودة
عن برنامج إدارة الجودة
وظائف برنامج إدارة الجودة
أهداف وغايات برنامج إدارة الجودة
المنشورات
قائمة الأبحاث المنشورة
اعتماد نشر بحث
كتيبات المركز
مجلة المركز
دورات المركز
المؤتمرات والندوات
برامج المركز التدريبية
المؤتمرات وورش العمل
المؤتمرات
ورش العمل
الندوات والدورات التدريبية
شركاؤنــا
شركاؤنا الأكاديميون
محليـــاً
دوليـــاً
الشركات المشاركة
محليـــاً
دوليـــاً
روابط ذات صلة
أكاديمية
مجلات وجرائد
منظمات غير حكومية
منظمات عالمية
قواميس طبية
محركات بحث للباحثين
ألبوم الصور
الملفات
اتصل بنا
الوصول إلى المركز
خريطة الموقع
آخر الأخبار
أحداثنــــا
أبحاث المركز
الأبحاث
نموذج طلب التوظيف
أهداف وغايات برنامج إدارة الجودة
عربي
English
عن الجامعة
القبول
الأكاديمية
البحث والإبتكار
الحياة الجامعية
الخدمات الإلكترونية
صفحة البحث
مركز التميز البحثي في علوم الجينوم الطبي
تفاصيل الوثيقة
نوع الوثيقة
:
مقال في مجلة دورية
عنوان الوثيقة
:
repDNA: a Python package to generate various modes of feature vectors for DNA sequences by incorporating user-defined physicochemical properties and sequence-order effects
repDNA: a Python package to generate various modes of feature vectors for DNA sequences by incorporating user-defined physicochemical properties and sequence-order effects
لغة الوثيقة
:
الانجليزية
المستخلص
:
In order to develop powerful computational predictors for identifying the biological features or attributes of DNAs, one of the most challenging problems is to find a suitable approach to effectively represent the DNA sequences. To facilitate the studies of DNAs and nucleotides, we developed a Python package called representations of DNAs (repDNA) for generating the widely used features reflecting the physicochemical properties and sequence-order effects of DNAs and nucleotides. There are three feature groups composed of 15 features. The first group calculates three nucleic acid composition features describing the local sequence information by means of kmers; the second group calculates six autocorrelation features describing the level of correlation between two oligonucleotides along a DNA sequence in terms of their specific physicochemical properties; the third group calculates six pseudo nucleotide composition features, which can be used to represent a DNA sequence with a discrete model or vector yet still keep considerable sequence-order information via the physicochemical properties of its constituent oligonucleotides. In addition, these features can be easily calculated based on both the built-in and user-defined properties via using repDNA.
ردمد
:
1367-4811
اسم الدورية
:
Bioinformatics
المجلد
:
31
العدد
:
8
سنة النشر
:
1436 هـ
2015 م
نوع المقالة
:
مقالة علمية
تاريخ الاضافة على الموقع
:
Sunday, April 24, 2016
الباحثون
اسم الباحث (عربي)
اسم الباحث (انجليزي)
نوع الباحث
المرتبة العلمية
البريد الالكتروني
Bin Liu
Liu, Bin
باحث رئيسي
Fule Liu
Liu, Fule
باحث مشارك
Longyun Fang
Fang, Longyun
باحث مشارك
Xiaolong Wang
Wang, Xiaolong
باحث مشارك
Kuo-Chen Chou
Chou, Kuo-Chen
باحث مشارك
الملفات
اسم الملف
النوع
الوصف
38659.pdf
pdf
الرجوع إلى صفحة الأبحاث